[R_PDH] Utilisation du logiciel R pour les requêtes PMSI sur la Plateforme des Données Hospitalières (PDH)

Sur la Plateforme des Données Hospitalières, les participants pratiquent la programmation dans le langage R pour les manipulations les plus courantes : construction de requêtes et statistiques descriptives sur les données du PMSI, export Excel.

Durée : 1 ou 2 jours selon le niveau de R des participants

Logiciels possibles : R

Pré-requis : Connaissance du PMSI, accès (token et droits) à la PDH

1. Prise en main du nouvel l’environnement de la  PDH

• Présentation  de  la nouvelle Architecture de la PDH
• Connexion à Teradata, package {pRatihque}
• Explorer et visualiser les tables du PMSI
• Spécificités du travail avec R + Teradata versus SAS Guide
• Bonnes pratiques dans l’utilisation de R sur la PDH

2. Manipulation de données avec {dbplyr} connecté à Teradata

• Principe de {dbplyr}
• Comptages
• Sélections
• Création de variables
• Formules simples et conversions de types
• Formules conditionnelles
• Combinaison de tables
• Tris et doublons
• Récupération du résultat dans R
• Stockage du résultat dans Teradata

3. Restitutions

• Statistiques descriptives
• Transpositions et tableaux croisés
• Export vers Excel